Seit vielen Jahren ist am Institut für Medizinische Genetik und Angewandte Genomik ein Qualitätsmanagementsystem etabliert.
Anfang 2012 erfolgte die Akkreditierung nach der internationalen Norm DIN EN ISO 17025 für „Prüflaboratorien“. Im Oktober 2014 folgte die Akkreditierung nach der internationalen Norm DIN EN ISO 15189 für „Medizinische Laboratorien“.
Die DAkkS – Deutsche Akkreditierungsstelle hat dem Institut für Medizinische Genetik und Angewandte Genomik die Kompetenz nach DIN EN ISO 15189 kontinuierlich bestätigt.
Im November 2020 wurde die Akkreditierung um die Next-Generation-Sequenzierung (NGS-basierte Verfahren) der Exom und Genomsequenzierung sowie ein somatisches Tumorpanel erweitert.