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Core Facility for Medical Bioanalytics (CFMB)

Die Core Facility für Medizinische Bioanalytik ist Teil des Medizinischen Proteom-Zentrums am Institut für Augenheilkunde. Wir stellen Ressourcen und Service zur Verfügung, um Wissenschaftlern Zugang zu proteom- und metabolomanalytischen Untersuchungen zu ermöglichen. Durch ausführliche Beratung bei der Planung, Durchführung und Auswertung möchten wir den Einstig in diese Technologien erleichtern und damit modernste, massenspektrometrische Methoden für nicht Experten anwendbar machen. Da wir diese Leistungen gemeinsam mit QBIC (siehe Hochdurchsatztechnologien) anbieten, ist auch die Vorhaltung der Daten, sowie die bioinformatische Analyse Bestandteil unseres Angebots.

Leitung

Professor Dr. Marius Ueffing

Direktor des Forschungsinstitutes für Augenheilkunde

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Ansprechpartner

Dr. Karsten Boldt

Proteomics

E-Mail-Adresse: karsten.boldt@uni-tuebingen.de

Telefonnummer: 07071 29-84950

Dr. Mohamed Ali Jarboui

Proteomics

Telefonnummer: 07071 29-80736

Leistungsverzeichnis Proteomics

LC SystemeMassenspektrometer
Dionex Ultimate 3000 RCLCnanoThermo Scientific Orbitrap Fusion
Dionex Ultimate 3000 RCLCnanoThermo Scientific QExactive Plus
Dionex Ultimate 3000 RCLCnanoThermo Scientific LTQ Orbitrap Velos
Eksigent EKSPERT microLC 200ABSciex QTRAP 6500
Proteomics (Qualitativ)Proteomics (Quantitativ)Analyse von Proteinkomplexen
Shotgun ProteomicsSILACAffinitätsreinigung (AP-MS) über Tags oder Antikörper
Zielgerichtete Analyse (SRM, PRM)Label-free QuantifizierungQuantitative AP-MS
 Zielgerichtete Analyse (SRM, PRM)Vergleichende Analyse (z.B. ± Stimulus)

Dr. Janina D'Alvise

Metabolomics

E-Mail-Adresse: janina.dalvise@uni-tuebingen.de

Telefonnummer: 07071 29-80863

Leistungsverzeichnis Metabolomics

LC SystemeIonenquellenMassenspektrometer
Eksigent EKSPERT microLC 200ESIABSciex QTRAP 6500
Waters Acquity UPLC

ABSciex SelexIon

(ion mobility)
Thermo Scientific LTQ Orbitrap XL
 APCI 


 Analyten
Methodenentwicklung für die zielgerichtete Analyse von kleinen Molekülen (Targeted Metabolomics)On demand und abhängig von zur Verfügung stehenden Kapazitäten.
Biocrates AbsoluteIDQ® p180 KitAmino acids (Q), biogenic amines (Q), acetylcarnitines (SQ), sum of hexoses (SQ), sphingomyelins (SQ), phosphatidylcholines (SQ)
Biocrates BA KitBile acids (Q)
Chromsystems KitAmino acids (SQ) +  acetylcarnitines (SQ)

 

 

(Q) = quantitativ; (SQ) = semiquantitativ

Wir können für beide Technologien ein breit gefächertes Angebot von der Probenvorbereitung bis zur Datenauswertung anbieten. Sollte der gewünschte Ansatz hier nicht aufgeführt sein, stehen wir für Fragen gerne zur Verfügung.

Geräteausstattung

 

PBI Barocycler® NEP 2320 PCT SPS
Precellys 24 Homogenisator

 

 

Leistungen
  • Protein Verdau (In solution, in gel, FASP, pressure-assisted)
  • SDS-PAGE
  • Isoelektrische Fokussierung (IEF)
  • Extraktion von kleinsten Probenmengen
  • Metabolomics und Proteomics aus einer Probe
  • Prozessierung von Formalin-fixierten, Paraffin-eingebetteten (FFPE) Proben
  • Prozessierung von komplexem Probenmaterial, z.B. Gewebsproben, Plasma (Metabolomics), CSF, Tränenflüssigkeit, Urin

 

Sobald Sie über die Möglichkeit einer Zusammenarbeit mit uns nachdenken, können Sie uns oder auch QBIC gerne kontaktieren. Die Kontaktaufnahme sollte auf jeden Fall vor Beginn der Probennahme bzw. Probengenerierung stattfinden. Nur dann können wir gemeinsam die Erfolgsaussichten abschätzen und optimieren. Hier wird auch eine gemeinsame Besprechung mit QBIC stattfinden. In Rahmen dieser Besprechung sollte das Projekt vorgestellt werden, um eine fundierte Planung der Studie und ein Angebot zu erstellen.

Nach erfolgter Probengenerierung, können sie durch QBIC angenommen und mit Barcodes versehen werden, wodurch das Nachverfolgen der Proben ermöglicht wird. Sobald die Messergebnisse vorliegen, werden die Daten von QBIC ausgewertet, und die Ergebnisse können von den Nutzern online abgerufen werden.

Die langfristige Datenspeicherung ist durch QBIC gesichert und auch die Abrechnung der Leistungen erfolgt direkt über QBIC

KooperationspartnerLink
Dr. Johannes GloecknerDZNE Tübingen
Gesellschaft für Rechtsmedizinische Untersuchungen und Sachverständigentätigkeit mbHGRUS
Professor Dr. Ingeborg Krägeloh-Mann, Universitätsklinik für Kinder- und Jugenmedizin, Abteilung für Neuropädiatrie, Entwicklungsneurologie und SozialpädiatrieAbteilung Kinderheilkunde III
Professor Dr. med. Lars Zender, Medizinische Klinik und Poliklinik, Abteilung Innere Medizin I, Sektion für Translationale Gastrointestinale Onkologie
Dr. Sven NahnsenQBIC
Professor Dr. Bernd Pichler,
Werner Siemens Imaging Center Tübingen
Preclinical Imaging
Dr. Oliver Pötz, Naturwissenschaftliches und Medizinisches Institut (NMI) der Universität TübingenNMI
Retina Implant AGHomepage
Professor Dr. Katja Schenke-Layland, Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology (IGB), Department for Women's Health at the University Women's Hospital TubingenHomepage
Dr. Sven Schnichels, Department für Augenheilkunde Tübingen,
Universitäts Augenklinik
Nanopartikel
Dr. Rebecca Schüle, Genomik seltener Bewegungsstörungen,
Hertie-Institut für klinische Hirnforschung Tübingen
Homepage
Professor Dr. Cora Weigert, Medizinische Klinik und Poliklinik,
Abteilung Innere Medizin IV
Zentrallabor
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