Die Abteilung Sportmedizin am UKT ist lizenziertes Untersuchungszentrum des Deutschen Olympischen Sportbundes (DOSB) und des Landessportverbandes Baden-Württemberg (LSV) und ist für die sportmedizinischen Jahreshauptuntersuchungen (JHU) von Bundes- und Landeskaderathleten zuständig. Die Durchführung der JHU erfolgt in den beiden Ambulanzen der Abteilung am Tübinger Uniklinikum und am Olympiastützpunkt im SpOrt Stuttgart und wird den Sportlern im jährlichen Turnus angeboten. Ein zentrales Element der medizinischen Betreuung stellt dabei auch die Dopingprävention dar.
Die Aufgaben im Leistungssport umfassen weiterhin die Vorortbetreuung von Athlet*innen in Training und Wettkampf. Derzeit erfolgen solche Betreuungsmaßnahmen durch ärztliche Mitarbeiter/-innen in den Sportarten Leichtathletik (Deutscher Leichtathletikverband) und im Fußball (Deutscher Fußballbund).